file:h5#

add(to_item, item[, atom_indices, ...])

append_structures(item[, structure_id, ...])

copy(item[, output_filename, progress_bar, ...])

extract(item[, atom_indices, ...])

get

has_attribute(molecular_system, attribute[, ...])

is_form(item)

StructuresIterator(molecular_system[, ...])

TopologyIterator(molecular_system[, ...])

merge(items[, atom_indices, ...])

set

to_file_pdb(item[, atom_indices, ...])

to_mdtraj_HDF5TrajectoryFile(item[, ...])

to_mdtraj_Topology(item[, atom_indices, ...])

to_mdtraj_Trajectory(item[, atom_indices, ...])

to_molsysmt_MolSys(item[, atom_indices, ...])

to_molsysmt_Structures(item[, atom_indices, ...])

to_molsysmt_Topology(item[, atom_indices, ...])

to_nglview_NGLWidget(item[, atom_indices, ...])

to_openmm_Topology(item[, atom_indices, ...])