molsysmt.element.group package

Subpackages

• molsysmt.element.group.amino_acid package
  • Submodules
  • molsysmt.element.group.amino_acid.get_1_letter_code_from_name module
    • get_1_letter_code_from_name()
  • molsysmt.element.group.amino_acid.get_bonded_atom_pairs module
    • get_bonded_atom_pairs()
  • molsysmt.element.group.amino_acid.get_group_db module
    • get_group_db()
    • path()
  • molsysmt.element.group.amino_acid.get_group_type_from_group_name module
  • molsysmt.element.group.amino_acid.group_names module
    • path()
  • molsysmt.element.group.amino_acid.group_types module
  • molsysmt.element.group.amino_acid.is_amino_acid module
    • is_amino_acid()
  • Module contents
• molsysmt.element.group.ion package
  • Submodules
  • molsysmt.element.group.ion.get_bonded_atom_pairs module
    • get_bonded_atom_pairs()
  • molsysmt.element.group.ion.get_group_db module
    • get_group_db()
    • path()
  • molsysmt.element.group.ion.group_names module
    • path()
  • molsysmt.element.group.ion.is_ion module
    • is_ion()
  • Module contents
• molsysmt.element.group.lipid package
  • Submodules
  • molsysmt.element.group.lipid.is_lipid module
    • is_lipid()
  • molsysmt.element.group.lipid.lipid_names module
  • Module contents
• molsysmt.element.group.nucleotide package
  • Submodules
  • molsysmt.element.group.nucleotide.is_nucleotide module
    • is_nucleotide()
  • molsysmt.element.group.nucleotide.nucleotide_names module
  • Module contents
• molsysmt.element.group.saccharide package
  • Submodules
  • molsysmt.element.group.saccharide.get_bonded_atom_pairs module
    • get_bonded_atom_pairs()
  • molsysmt.element.group.saccharide.get_group_db module
    • get_group_db()
    • path()
  • molsysmt.element.group.saccharide.group_names module
    • path()
  • molsysmt.element.group.saccharide.is_saccharide module
    • is_saccharide()
  • Module contents
• molsysmt.element.group.small_molecule package
  • Submodules
  • molsysmt.element.group.small_molecule.get_bonded_atom_pairs module
    • get_bonded_atom_pairs()
  • molsysmt.element.group.small_molecule.get_group_db module
    • get_group_db()
    • path()
  • molsysmt.element.group.small_molecule.group_names module
    • path()
  • molsysmt.element.group.small_molecule.is_small_molecule module
    • is_small_molecule()
  • molsysmt.element.group.small_molecule.small_molecule_is_amino_acid module
    • small_molecule_is_amino_acid()
  • Module contents
• molsysmt.element.group.terminal_capping package
  • Submodules
  • molsysmt.element.group.terminal_capping.get_bonded_atom_pairs module
    • get_bonded_atom_pairs()
  • molsysmt.element.group.terminal_capping.get_group_db module
    • get_group_db()
    • path()
  • molsysmt.element.group.terminal_capping.group_names module
    • path()
  • molsysmt.element.group.terminal_capping.is_c_terminal_capping module
    • is_c_terminal_capping()
  • molsysmt.element.group.terminal_capping.is_n_terminal_capping module
    • is_n_terminal_capping()
  • molsysmt.element.group.terminal_capping.is_terminal_capping module
    • is_terminal_capping()
  • Module contents
• molsysmt.element.group.water package
  • Submodules
  • molsysmt.element.group.water.get_bonded_atom_pairs module
    • get_bonded_atom_pairs()
  • molsysmt.element.group.water.is_water module
    • is_water()
  • molsysmt.element.group.water.water_names module
  • Module contents

Submodules

molsysmt.element.group.get_bonded_atom_pairs module

molsysmt.element.group.get_bonded_atom_pairs.get_bonded_atom_pairs(group_name, atom_names, atom_indices=None, sorted=True)

molsysmt.element.group.get_group_type module

molsysmt.element.group.get_group_type.get_group_type(molecular_system, element='group', selection='all', redefine_types=False, syntax='MolSysMT', skip_digestion=False)

molsysmt.element.group.get_group_type.get_group_type_from_group_name(group_name, skip_digestion=False)

molsysmt.element.group.is_group_type module

molsysmt.element.group.is_group_type.is_group_type(group_type)

Module contents