molsysmt.form.molsysmt_MolSys.set#

Functions

set_allows_implicit_hydrogens_to_atom(item)

set_atom_id_to_atom(item[, indices, value, ...])

set_atom_index_to_atom(item[, indices, ...])

set_atom_is_aromatic_to_atom(item[, ...])

set_atom_name_to_atom(item[, indices, ...])

set_atom_stereochemistry_to_atom(item[, ...])

set_atom_type_to_atom(item[, indices, ...])

set_b_factor_to_atom(item[, indices, ...])

set_bond_acceptor_atom_index_to_bond(item[, ...])

set_bond_donor_atom_index_to_bond(item[, ...])

set_bond_evidence_to_bond(item[, indices, ...])

set_bond_id_to_bond(item[, indices, value, ...])

set_bond_is_aromatic_to_bond(item[, ...])

set_bond_is_conjugated_to_bond(item[, ...])

set_bond_joins_components_to_bond(item[, ...])

set_bond_order_to_bond(item[, indices, ...])

set_bond_stereo_atom_indices_to_bond(item[, ...])

set_bond_stereochemistry_to_bond(item[, ...])

set_bond_type_to_bond(item[, indices, ...])

set_box_to_system(item[, structure_indices, ...])

set_chain_id_to_atom(item[, indices, value, ...])

set_chain_id_to_chain(item[, indices, ...])

set_chain_id_to_component(item[, indices, ...])

set_chain_id_to_group(item[, indices, ...])

set_chain_id_to_molecule(item[, indices, ...])

set_chain_index_to_atom(item[, indices, ...])

set_chain_index_to_chain(item[, indices, ...])

set_chain_index_to_component(item[, ...])

set_chain_index_to_group(item[, indices, ...])

set_chain_index_to_molecule(item[, indices, ...])

set_chain_name_to_atom(item[, indices, ...])

set_chain_name_to_chain(item[, indices, ...])

set_chain_name_to_component(item[, indices, ...])

set_chain_name_to_group(item[, indices, ...])

set_chain_name_to_molecule(item[, indices, ...])

set_chain_type_to_atom(item[, indices, ...])

set_chain_type_to_chain(item[, indices, ...])

set_chain_type_to_component(item[, indices, ...])

set_chain_type_to_group(item[, indices, ...])

set_chain_type_to_molecule(item[, indices, ...])

set_component_id_to_atom(item[, indices, ...])

set_component_id_to_component(item[, ...])

set_component_id_to_group(item[, indices, ...])

set_component_index_to_atom(item[, indices, ...])

set_component_index_to_component(item[, ...])

set_component_index_to_group(item[, ...])

set_component_name_to_atom(item[, indices, ...])

set_component_name_to_component(item[, ...])

set_component_name_to_group(item[, indices, ...])

set_component_type_to_atom(item[, indices, ...])

set_component_type_to_component(item[, ...])

set_component_type_to_group(item[, indices, ...])

set_constraints_to_system(item[, value, ...])

set_coordinates_to_atom(item[, indices, ...])

set_coordinates_to_system(item[, ...])

set_cutoff_distance_to_system(item[, value, ...])

set_dispersion_correction_to_system(item[, ...])

set_entity_id_to_atom(item[, indices, ...])

set_entity_id_to_chain(item[, indices, ...])

set_entity_id_to_component(item[, indices, ...])

set_entity_id_to_entity(item[, indices, ...])

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set_entity_index_to_atom(item[, indices, ...])

set_entity_index_to_chain(item[, indices, ...])

set_entity_index_to_component(item[, ...])

set_entity_index_to_entity(item[, indices, ...])

set_entity_index_to_group(item[, indices, ...])

set_entity_index_to_molecule(item[, ...])

set_entity_name_to_atom(item[, indices, ...])

set_entity_name_to_chain(item[, indices, ...])

set_entity_name_to_component(item[, ...])

set_entity_name_to_entity(item[, indices, ...])

set_entity_name_to_group(item[, indices, ...])

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set_entity_type_to_atom(item[, indices, ...])

set_entity_type_to_chain(item[, indices, ...])

set_entity_type_to_component(item[, ...])

set_entity_type_to_entity(item[, indices, ...])

set_entity_type_to_group(item[, indices, ...])

set_entity_type_to_molecule(item[, indices, ...])

set_ewald_error_tolerance_to_system(item[, ...])

set_flexible_constraints_to_system(item[, ...])

set_forcefield_to_system(item[, value, ...])

set_formal_charge_to_atom(item[, indices, ...])

set_fractional_bond_order_to_bond(item[, ...])

set_group_id_to_atom(item[, indices, value, ...])

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set_group_index_to_atom(item[, indices, ...])

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set_group_name_to_atom(item[, indices, ...])

set_group_name_to_group(item[, indices, ...])

set_group_type_to_atom(item[, indices, ...])

set_group_type_to_group(item[, indices, ...])

set_hydrogen_mass_to_system(item[, value, ...])

set_implicit_solvent_to_system(item[, ...])

set_isotope_to_atom(item[, indices, value, ...])

set_kappa_to_system(item[, value, ...])

set_molecule_id_to_atom(item[, indices, ...])

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set_molecule_id_to_component(item[, ...])

set_molecule_id_to_group(item[, indices, ...])

set_molecule_id_to_molecule(item[, indices, ...])

set_molecule_index_to_atom(item[, indices, ...])

set_molecule_index_to_chain(item[, indices, ...])

set_molecule_index_to_component(item[, ...])

set_molecule_index_to_group(item[, indices, ...])

set_molecule_index_to_molecule(item[, ...])

set_molecule_name_to_atom(item[, indices, ...])

set_molecule_name_to_chain(item[, indices, ...])

set_molecule_name_to_component(item[, ...])

set_molecule_name_to_group(item[, indices, ...])

set_molecule_name_to_molecule(item[, ...])

set_molecule_type_to_atom(item[, indices, ...])

set_molecule_type_to_chain(item[, indices, ...])

set_molecule_type_to_component(item[, ...])

set_molecule_type_to_group(item[, indices, ...])

set_molecule_type_to_molecule(item[, ...])

set_n_implicit_hydrogens_to_atom(item[, ...])

set_n_unpaired_electrons_to_atom(item[, ...])

set_non_bonded_method_to_system(item[, ...])

set_occupancy_to_atom(item[, indices, ...])

set_rigid_water_to_system(item[, value, ...])

set_salt_concentration_to_system(item[, ...])

set_solute_dielectric_to_system(item[, ...])

set_solvent_dielectric_to_system(item[, ...])

set_structure_chemical_state_index_to_system(item)

Setting nullable chemical-state indices aligned to structures.

set_structure_id_to_system(item[, ...])

set_switch_distance_to_system(item[, value, ...])

set_time_to_system(item[, ...])

set_velocities_to_atom(item[, indices, ...])

set_water_model_to_system(item[, value, ...])